21世纪初，人类将(jiāng )多(🙀)数人留在被(bèi )哥斯(sī )拉(lā )蹂躏的地(🧤)球上，仅使被选(xuǎn )中的人们(men )(🤳)乘上恒星(xīng )间移民(mín )船·阿拉(lā )特拉姆(mǔ )，前往能够移(🏉)居的“约定之地(🐾)·τ星e”。但这一计(jì )划(huá )失败(🃏)，人类(🌼)只得再(zài )度返回地球。而(💿)长距离亚空间航行所引发的时(💏)空(kōng )歪曲，导(♌)致(zhì )人类(lèi )回到(🏃)的地方(🚲)变成了“两万年(🐖)后的地球”。在这个(⏳)地球(🚽)，主(zhǔ )人(rén )公·晴男等(🎦)人(rén )在遭受哥(🐂)斯(sī )拉袭击(jī )的同时，与埃克西弗、比尔沙尔(⛴)德两种(💁)族(zú )的异(yì )星(🔮)人共同(tóng )实行谋划了(💕)20年的“对哥(gē )斯拉战(⛅)术”，通过(guò )(🙅)殊死(sǐ )(🛌)战斗成功击倒了哥斯拉。
但喜悦并未持(📦)续多久(⤴)，深(shēn )藏地下的(de )真(🎅)正哥斯拉“哥斯拉·(🍑)地球(🛳)”现(xiàn )身了。两万(wàn )年间持续成(chéng )(👌)长生存(cún )、身高300米(😇)、质量超(🌵)过10万(wàn )吨(♉)，在进化成这(➗)种姿态(tài )的(de )超(🐁)巨大(dà )哥(🛰)斯(sī )拉压倒(dǎo )性的(de )破坏力(lì )面前，晴男等人(☕)落花流水。
拯救(🈁)了晴男的(📠)是(🐢)被视为人类(👪)的(🙊)残(cán )存者“弗图亚”之民，米亚(yà )娜(📘)。弗图亚(📼)是他(tā )们在(zài )这个地(🈶)球首次遇(yù )到的人(🎙)型生命(🐷)种(zhǒng )族。他(❤)们会是(➖)人类的子孙吗——。“弗图(👥)亚的(😍)神也(yě )被哥斯拉击(jī )破，如今只剩下卵。挑战(zhàn )者、抗(kàng )争(❎)者(🐥)，全部被火焰吞噬而消(xiāo )失(🚴)了(🎶)”面对这(zhè )样的他们(men )，晴男(😐)回应道“这是以人类的双手夺(🤯)回地球(💳)的最后机会了(le )”。
(🈸) 另(lìng )一方面，比尔(ěr )沙(shā )尔德的(de )(🚿)指挥官·加尔格，注意到弗(🏵)图(tú )亚(yà )使(📕)用的(de )箭头(🚳)是(🌯)由“自律思(sī )(😫)考(kǎo )金属(shǔ )体·(🔜)纳米(🎎)金属”所(suǒ )制造而欢喜。这和21世(🥍)纪(jì )他(🦒)们在富士山麓作为(wéi )“对哥斯拉(🍨)决战兵器”所(suǒ )开发、在启动前遭(😜)到破坏(🐌)的“机(jī )械哥(🎟)斯拉”由(yóu )同种(🏋)物质所构成。这正是(👈)当时(shí )的开(kāi )发设(shè )备至今仍(réng )(🎄)然残存(cún )的证明(🤚)——。